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生物信息学综合了数学、计算机科学和生物学的各类工具,通过处理生物带来的数据获得我们想要的信息从而进行预测。比如,在已知的序列里,用计算机找到它在哪个物种的哪个染色体上的哪个位置?或者是已知了特定序列,在另一些序列里预测组成成分。
生物信息学和传统的生物学不同,包含了NGS和基因组学。只有真正了解数据的来源,才能更好地分析和处理,挖掘出背后隐含的生物知识,那么如果你想进入生物信息领域,你需要的基本知识点有哪些呢?
1)了解基因组、转录组、蛋白组、染色体、基因、表现遗传、变异类型等一些列生物原理
2)明白NGS技术、测序仪、NDA检测的基本方法
除了基本的生物基础理论,生物信息学家需要具备以下技术点。当然大家不需要在以下每个方面都是专家,但至少应该了解,并在某些方面有一些实践的经历:
1) 掌握Linux进行在Terminal中进行数据分析
2) 至少掌握一门高级编程语言,首先推荐Python,其次如果有能力掌握C/C++则更好
3) 学会使用常用的组学数据分析软件,比如bwa、samtools和picard等
4) 有一定的数理基础和统计学基础,包括常用的假设检验,贝叶斯推断和回归分析等
5) 多看开源的组学算法,比如在github上多了解
6) 留意最顶级的CNNS杂志
7) 专业与就业(国内高校数据)
据数据显示,生物信息学专业毕业生规模为1000-1500人,男女比例为:男生占50%,女生占50%,近三年全国就业率在90-98%,处于毕业生人数相对较少,但其就业率还是相当不错的。
生物信息学是分子生物学和计算机科学相互交叉形成的新兴前沿学科,本专业是根据21世纪具市场活力的新兴生物信息产业市场需求而设置的新专业。我国生物学本科教育主要围绕两个专业——生物科学和生物技术进行,而生物信息学相关课程通常作为这两个专业高年级学生的选修课,且要求学生们已修完大部分专业必修课以及一些计算机课程,如C语言等。
同时,越来越多的政府部门、教育机构和企业都呼吁加快培养各类生物信息学人才。据有关数据显示,目前对生物信息学专业需求最大的是制药和生物工程领域,占社会总需求的45%,所以想要找到对口的工作并不难。
本专业学生毕业后可在各级生物信息学的研究机构、高等学校、企事业单位以及在研究和成果产业化过程中涉及到生物信息学的相关部门,从事科学研究、教学和管理工作。
① 生化、科研类单位:生物研究、基因组学研究、蛋白质组学研究。
② 医药类企业:生物工程、生物技术、生物制药、药品研发、药品销售等等。
生物学、生物化学与分子生物学、生物医学工程、生物工程等。
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