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加州大学伯克利分校的计算机科学专业设置有很多独树一帜的地方，尤其在专业基础课方面，除了有专业导引课程 “ 计算机科学专题 ” 外，对于没有编程经验的学生，门课是符号编程入门，采用 LISP 语言，而对于有一定编程经验的学生，则可以选择多种语言和环境的自主学习（ Self-pace ）课程，包括 C 、 Fortran 、 C++ 、 Java ，以及 UNIX 的使用等。
这种多元化与伯克利计算机科学与电子电气工程同系有关，但是所有学生在第二学期都要学习一组独特的基础课： 61A“ 计算机程序的结构与解释 ” ，采用 MIT Abelson 等编著的同名教材（中译本机械工业出版社出版，清华大学出版社出版了影印版）； 61B“ 数据结构 ” （教材采用自编讲义）； 61C“ 计算机结构 ” （ Machine Structures ），采用 Hennessy 的《计算机组织与设计》（中译本清华大学出版社出版，机械工业出版社出版了影印版）。这项规定就是转校生也不例外，可见其中蕴涵了伯克利多年的教学经验结晶。
加州大学伯克利分校其他比较有特点的课程还有：将离散数学和概率论结合讲授的 CS70 ，主讲是名教授 Christos Papaimitriou ； CS98-1 编程练习课，以主要大学生编程竞赛中的赛题为授课素材； CS 169 软件工程直接用 Kent Beck 的《极限编程》作为教材，非常超前，但是既然连 Pressman 的《软件工程：实践者方法》新版中敏捷方法都已经成为重头戏，既然 IEEE 都已经开始制定敏捷方法相关标准，这种课程选材也就不显得那么骇世惊俗了。除了软件工程课程常见内容外，教学侧重实际，贯穿了极限编程的思想，涵盖 UML 、 JUnit 单元测试、软件架构、设计模式和反模式、重构、 CVS 版本控制、系统和集成测试，最后要求完成一个实际产品，并进行演示。
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