生物信息学的主要研究方向：基因组学 - 蛋白质组学 - 系统生物学 - 比较基因组学，1989年在美国举办生物化学系统论与生物数学的计算机模型国际会议，生物信息学发展到了计算生物学、计算系统生物学的时代。

美国研究生生物信息学与计算生物学学校列表
1 普林斯顿大学 计量与计算生物学 Quantitative an Computational Biology PhD 自然科学部
生物信息学与计算生物学 Bioinformatics & Computational Biology MS、PhD 计算机科学系
2 哈佛大学 生物信息学与基因组学 Bioinformatics an Integrative Genomics PhD 哈佛医学科学部
生物信息学硕士 Master's in Bioinformatics Master 继续教育学院
计算生物学与计量遗传学 Computational Biology & Quantitative Genetics MS 公共卫生学院
计算生物学 Computational Biology PhD 综合生命科学(HILS)
3 耶鲁大学 生物信息学与计算生物学 Bioinformatics & Computational Biology PhD 生物与生物医学科学 生物信息学 Bioinformatics MS 计算机科学系
4 哥伦比亚大学 生物医学信息学 Biomeical Informatics PhD 基础科学研究生院
计算生物学、生物信息学与系统生物学 Computational Biology & Bioinformatics / Systems Biology PhD 基础科学研究生院 计算生物学 Computational Biology MS、PhD、D.Eng 计算机科学系
4 芝加哥大学 结构与计算生物学 Structural an Computational Biology PhD 分子生物科学博士项目
4 芝加哥大学 生物医学信息学硕士 MSc Biomeical Informatics MS 继续教育学院
4 斯坦福大学 生物医学信息学 Biomeical Informatics PhD 医学院-生物科学项目
7 麻省理工学院 生物信息学与计算生物学 Bioinformatics & Computational Biology PHD、DS 电气工程与计算机科学系 生物信息学与计算生物学 Bioinformatics/Computational Biology PhD 生物学系
8 杜克大学 生物统计学博士PhD in Biostatistics （文理学院）   生物统计硕士Master of Biostatistics（医学院） 计算生物学与生物信息学 Computational Biology an Bioinformatics PhD 文理学院

9 宾夕法尼亚大学 生物信息学 Bioinformatics MSE、PhD 计算机与信息科学系；基因组学与计算生物学 Genomics an Computational Biology PhD 生物医学博士项目

10 约翰霍普金斯大学 生物信息学与计算生物学 Bioinformatics an Computational Biology MS、PhD 生物医学工程系；生物信息学 MS in Bioinformatics MS 文理学院-高等学术项目；计算生物学与医学 Computational Biology & Meicine MSE、PhD 计算机科学系
14 布朗大学
计算生物学计算分子生物学博士Computational Biology
PhD Program in Computational Molecular Biology
计算分子生物中心和计算机科学系 应用数学学部
15 康奈尔大学 计算生物学与生物信息学 Computational Biology an Bioinformatics MS、PhD 计算机科学系；计算生物学 Computational Biology PhD 文理学院
15 范德堡大学 生物医学信息学 Biomeical Informatics MS、PhD 公共卫生学院
15 圣路易斯华盛顿大学 生物医学信息学 Biomeical Informatics MS、PhD 计算机科学与工程系
高性能计算生物小组 High Performance Computational Biology Group MS、PhD 计算机科学与工程系
18 莱斯大学 生物信息学与计算生物学 Bioinformatics & Computational Biology MS、MA、PhD 理学院
生物信息学 Bioinformatics MS、PhD 生物工程系
生物信息学 Bioinformatics MS、PhD 计算机科学系
生物信息与生物工程研究所 Institute of Biosciences an Bioengineering (IBB) M.Eng、PhD 电气与计算机工程系
生物统计、生物信息与遗传流行病学 Biostatistics, Bioinformatics an Genetic Epiemiology MS、PhD 生物统计系
计算生物学 Computational Biology MS、PhD 生物科学系
18 圣母大学 生物信息学实验室 Bioinformatics Laboratory MS、PhD 计算机科学与工程系
计算生物学与生物信息学 Computational Biology an Bioinformatics MS、PhD 计算机科学与工程系
生物信息学与生物统计学 Bioinformatics an Biostatistics MS、PhD 应用计算数学与统计学系
数学与计算生物学 Mathematical an Computational Biology MS、PhD 应用计算数学与统计学系
遗传学、基因组学与生物信息学 Genetics, Genomics, an Bioinformatics MS、PhD 生物科学系
计算生物学与生物信息学 Computational Biology an Bioinformatics PhD 生物医学项目（IBS）
计算生物学 Computational Biology PhD 生物工程系
20 加州大学伯克利分校 生物信息学 Bioinformatics PhD 生物学系
生物系统与计算生物学 Biosystems & Computational Biology MS、PhD 电气工程与计算机科学系
计算生物学与基因组学 Computational Biology an Genomics PhD 生物物理项目
21 艾茉莉大学 生物医学信息学 Biomeical Informatics MS、PhD 数学与计算机科学系
生物统计学与生物信息学 Biostatistics an Bioinformatics MPH、PhD 公共卫生学院
生物信息与生物医学系统分析 Bioinformatics an Biomeical Systems Analysis PhD 生物医学工程系
生物信息学与比较基因组学 Bioinformatics an Comparative Genomics PhD 遗传学与分子生物学博士项目
21 乔治敦大学 生物化学与分子生物学-生物信息学方向 Biochemistry & Molecular Biology, Bioinformatics MS 生物医学项目
23 卡耐基梅隆大学 计算生物学 Computational Biology MS、PhD 计算生物学系
计算生物学与生物信息学 Computational Biology & Bioinformatics PhD 生物科学系
23 加州大学洛杉矶分校 结构与计算生物学 Structural an Computational Biology PhD 化学与生物化学系
生物信息学与计算生物学 Bioinformatics an Computational Biology MS、PhD 生物统计系
生物信息学 Bioinformatics PhD 生物科学研究生项目
23 南加州大学 计算生物学与生物信息学 Computational Biology an Bioinformatics PhD 生物科学系
26 弗吉尼亚大学 计算生物学 Computational Biology MS、PhD 计算机科学系
计算生物学 Computational Biology PhD 生物医学科学研究生项目
生物信息学与基因组学 Bioinformatics & Genomics PhD 生物医学科学研究生项目
27 塔夫斯大学 计算生物学 Computational Biology MS、PhD 计算机科学系
生物信息学 Bioinformatics MS、M.Eng 生物工程专业
27 维克森林大学 计算生物学 Computational Biology MS 计算机科学系
29 密歇根大学安娜堡分校 生物信息学 Bioinformatics MS、PhD 医学院-计算医学与生物信息学系
30 波士顿学院 生物信息学 Bioinformatics MST、PhD 生物学系
30 北卡罗来纳大学教堂山分校 生物信息与计算生物学 Bioinformatics an Computational Biology PhD 生物与生物医学科学项目（BBSP）
生物信息与计算生物学 Bioinformatics an Computational Biology MS、PhD 计算机科学系
33 纽约大学 生物信息与计算生物学 Bioinformatics an Computational Biology PhD 生物学系
生物信息学与系统生物学 Bioinformatics an Systems Biology MS 生物学系
计算生物学 Computational Biology MS、PhD 计算机科学系
计算生物学 Computational Biology PhD 医学院-基础医学项目
33 罗切斯特大学 生物物理、结构与计算生物学 Biophysics, Structural & Computational Biology PhD 医学中心
统计学博士-生物信息学与计算生物学方向 PhD in Statistics (Bioinformatics an Computational Biology) PhD 生物统计学与计算生物学系
生物信息学与生物传感 Bio-Informatics & Biosensing MS、PhD 电气与计算机工程系
34 威廉玛丽学院 生物信息学 Bioinformatics MS、PhD 水产健康科学系
数学与计算生物学 Mathematical an Computational Biology MS、PhD 应用科学系
36 佐治亚理工学院 生物信息学 Bioinformatics PhD 工程学院+理学院+计算学院联合开设
生物信息学 Bioinformatics MS 生物学院
37 凯斯西储大学 生物信息学、计算基因组学与计算生物学 Bioinformatics, Computational Genomics an Computational Biology MS、PhD 电气工程与计算机科学系
系统生物学与生物信息学 Systems Biology an Bioinformatics MS、PhD 生物医学领域
37 加州大学圣塔芭芭拉分校 生物信息学 Bioinformatics MS、PhD 计算机科学系
39 加州大学尔湾分校 生物医学信息学与计算生物学 Biomeical Informatics an Computational Biology MS、PhD 信息与计算机科学系
医学信息学 Meical Informatics MS、PhD 信息与计算机科学系
数学与计算生物学 Mathematical an Computational Biology MS、PhD 数学系
39 加州大学圣地亚哥分校 生物信息学 Bioinformatics PhD 生物学部
生物信息学 Bioinformatics MS、M.Eng、PhD 生物工程系
生物信息学 Bioinformatics MS、PhD 计算机科学与工程系
41 波士顿大学 生物信息学 Bioinformatics MS、PhD 交叉学科
生物信息学硕士-转化医学方向 MS in Bioinformatics with a focus on Translational Meicine MS 交叉学科
41 伦斯勒理工学院 生物信息学 Bioinformatics MS、PhD 数学系、计算机科学系
41 杜兰大学 生物信息学硕士 MS in Bioinformatics MS 公共卫生与热带医学院
生物统计与生物信息学 Biostatistics an Bioinformatics PhD 公共卫生与热带医学院
41 加州大学戴维斯分校 计算生物工程 Computational Bioengineering MS、PhD 生物医学工程系
计算生物学与生物信息学 Computational Biology an Bioinformatics MS、PhD 计算机科学系
41 伊利诺伊大学厄本那-香槟分校 生物信息学硕士 MS in Bioinformatics MS 计算机科学系
生物信息学硕士 MS in Bioinformatics MS 图书馆与信息科学学院
41 威斯康辛大学麦迪逊分校
计算生物学Computational Biology

生物统计与医学信息学Biostatistics an Meical Informatics

生物医学计算与信息Computation an Informatics in Biology an Meicine (CIBM）

MS、PhD计算机科学系、统计系 医学与公共卫生学院 交叉学科

47 里海大学 生物信息学 Bioinformatics MS、M.Eng、PhD 计算机科学系
计算生物工程 Computational Bioengineering MS、PhD 化学与生物分子工程系
47 东北大学 生物信息学 Bioinformatics MS 生物学系
47 东北大学 生物信息硕士 Master of Science in Bioinformatics MS Align项目
47 宾州州立大学公园分校 理论与计算生物学 Theoretical an Computational Biology MS、PhD 生物学系
生物信息学 Bioinformatics MS、M.Eng、PhD 计算机科学与工程系
生物信息咨询中心 Bioinformatics Consulting Center MS、PhD 哈克生命科学研究所
比较基因组学与生物信息学中心 Center for Comparative Genomics an Bioinformatics MS、PhD 哈克生命科学研究所
47 佛罗里达大学 生物信息学实验室 Bioinformatics Lab MS、PhD 计算机与信息科学工程系
51 迈阿密大学 生物信息学与计算生物学 Bioinformatics an Computational Biology MS、PhD 电气与计算机工程系
生物信息学 Bioinformatics MS、PhD 计算机科学系
52 俄亥俄州立大学 生物医学信息 Biomeical Information MS、MPH、PhD 生物医学信息系
52 德克萨斯大学奥斯汀分校 生物信息学与计算生物学 Bioinformatics an Computational Biology MS、PhD 计算机科学系
计算生物医学工程 Computational Biomeical Engineering MS、PhD 生物医学工程系
52 华盛顿大学 生物信息学与基因组学 Bioinformatics & Genomics MS、M.Eng、PhD 化学工程系
57 乔治华盛顿大学 分子生物化学与生物信息学硕士 MS in Molecular Biochemistry an Bioinformatics MS 生物化学和分子医学系
生物信息学与生物医学计算 Bioinformatics an Biomeical Computing MS、PhD 计算机科学系
57 康涅狄格大学 生物信息学与系统基因组学 Bioinformatics an Systems Genomics MS、PhD 生物医学工程系
57 马里兰大学学院公园分校 计算生物学、生物信息学与基因组学 Computational Biology, Bioinformatics & Genomics PhD 生物科学项目（BISI）
生物信息学与计算生物学 Bioinformatics an Computational Biology MS、PhD 计算机科学系
61 克莱蒙森大学 生物信息学与化学信息学 Bioinformatics an Chemical Informatics MS、PhD 计算学院
61 普渡大学西拉法叶分校 生物信息学与计算生物学 Bioinformatics an Computational Biology MS、PhD 计算机科学系
生物信息学 Bioinformatics MS、PhD 生物科学系
生物信息学与健康信息学 Bioinformatics an Health Informatics MS 计算机信息技术系
61 佐治亚大学 生物信息学 Bioinformatics PhD 文理学院-整合生命科学项目（ILS)
生物信息学 Bioinformatics MS 文理学院
66 杨百翰大学 生物信息学 Bioinformatics MS、PhD 生物学系
66 福坦莫大学 生物信息学 Bioinformatics MS 计算机与信息科学专业
66 匹兹堡大学 生物医学信息学 Biomeical Informatics MS、PhD 生物医学信息学系
计算生物学 Computational Biology PhD 与卡耐基梅隆大学联合开设
计算生物学 Computational Biology PhD 生物科学系
69 明尼苏达大学双城分校 生物信息学与计算生物学 Bioinformatics an Computational Biology （MS、PhD）

PhD 计算机科学与工程系 生物科学学院
70 德州农工大学 生物信息学 Bioinformatics MS、PhD 计算机科学与工程系
70 弗吉尼亚理工学院 计算生物学与生物信息学 Computational Biology an Bioinformatics MS、PhD 计算机科学系
计算生物学与生物信息学 Computational Biology an Bioinformatics MS、PhD 生物科学系
遗传学、生物信息学与计算生物学 Genetics, Bioinformatics, an Computational Biology PhD 交叉科学项目
72 贝勒大学 生物信息学 Bioinformatics MS 计算机科学系
72 罗格斯大学 计算生物学与分子生物物理 Computational Biology an Molecular Biophysics MS、PhD 文理学院
75 印第安纳大学伯明顿分校 生物信息学 Bioinformatics MS、PhD 信息与计算学院
75 密歇根州立大学 基因组学、生物信息与计算生物学 Genomics, Bioinformatics an Computational Biology PhD 计量生物学交叉项目
75 特拉华大学 生物信息学 Bioinformatics MPS 工程学院
生物信息学与计算生物学 Bioinformatics an Computational Biology MS 工程学院
生物信息学与系统生物学 Bioinformatics an Systems Biology PhD 工程学院
生物信息学 Bioinformatics MS、PhD 计算机科学系
82 迈阿密大学（俄亥俄） 生物信息学 Bioinformatics MS 工程学院
82 加州大学圣克鲁兹分校 生物分子工程与生物信息学 Biomolecular Engineering & Bioinformatics MS、PhD 工程学院
生物信息学与计算生物学 Bioinformatics & Computational Biology PhD 物医学科学与工程项目
82 马凯特大学 生物信息学硕士 MS in Bioinformatics MS 数学、统计学与计算科学系
89 纽约州立大学宾汉姆顿分校 计算生物学 Computational Biology MS、PhD 生物医学工程项目
89 北卡罗来纳州立大学 生物信息学 Bioinformatics MR、PhD 理学院
功能基因组学 Functional Genomics MR、MS、PhD 理学院
89 纽约州立大学石溪分校
计算生物学
生物医学信息学
Computational Biology
Biomeical informatics
MS、PhD
MS、PhD
应用数学与统计专业
医学院、工程学院
89 科罗拉多大学博尔德分校 计算生物学 Computational Biology MS、PhD 计算机科学系
96 佛罗里达州立大学 计算科学硕士-计算生物分子科学与生物信息学方向 PSM in Computational Science (Computational Molecular Biology/Bioinformatics) MPS 文理学院
99 德雷塞尔大学 生物信息学 Bioinformatics MS、PhD 生物医学工程系
生物信息学 Bioinformatics MS、PhD 生物医学系
99 纽约州立大学水牛城分校 医学应用与生物信息学 Meical Applications an Bioinformatics MS、PhD 计算机科学与工程系
遗传学、基因组学与生物信息学 Genetics, Genomics an Bioinformatics PhD 医学与生物医学院-生物医学博士项目
103 密苏里大学 信息学：生物信息学 Informatics: Bioinformatics PhD 工程学院
103 俄勒冈大学 生物学硕士（生物信息学方向） MS in Biology with a focus in Bioinformatics MS 文理学院
107 罗切斯特理工学院 生物信息学硕士 MS in Bioinformatics MS 理学院
108 伊利诺伊理工学院 生物信息学、信息理论与通信实验室 Bioinformatics, Information Theory, an Communications Laboratory MS、PhD 电气与计算机工程系
108 爱荷华州立大学 生物信息学与计算生物学 Bioinformatics an Computational Biology MS、PhD 遗传学、发育与细胞生物学项目（GDCB）
生物信息学与计算生物学 Bioinformatics an Computational Biology MS、PhD 计算机科学系
115 堪萨斯大学 生物信息学 Bioinformatics PhD 文理学院
生物信息学与计算生物学 Bioinformatics an Computational Biology PhD 分子生物科学系
生物信息学 Bioinformatics MS、PhD 生物工程系
115 犹他大学 生物信息学 Bioinformatics MS、PhD 生物工程系
121 亚利桑那大学 系统与计算生物学 Systems an Computational Biology PhD 分子与细胞生物学系
121 加州大学河滨分校 遗传学、基因组学与生物信息学 Genetics, Genomics & Bioinformatics PhD 细胞生物学与神经科学系
计算生物工程 Computational Bioengineering MS、PhD 生物工程系
129 亚利桑那州立大学 基因组学、演化与生物信息学 Genomics, Evolution & Bioinformatics PhD 生命医学系
计算机科学硕士-生物信息学方向 MS Computer Science (Biomeical Informatics) MS 计算机科学系
129 伊利诺伊大学芝加哥分校 生物信息学 Bioinformatics MS、PhD 工程学院
135 乔治梅森大学 生物信息学和计算生物学 Bioinformatics an Computational Biology MS、PhD 理学院
生物信息学管理 Bioinformatics management MS 理学院
140 新泽西理工学院 生物信息学 Bioinformatics MS 计算学院
计算生物学 Computational Biology MS 文理学院
140 罗格斯大学纽华克分校 计算生物学 Computational Biology MS 文理学院
140 德克萨斯大学达拉斯分校 生物信息学与计算生物学 Bioinformatics an Computational Biology MS 自然科学与数学学院
149 俄克拉荷马州立大学 生物信息学 Bioinformatics MS、PhD 计算机科学系
149 圣地亚哥州立大学 生物信息与医学信息学 Bioinformatics an Meical Informatics MS 理学院
149 阿拉巴马大学伯明翰分校 功能基因组学与生物信息学 Functional Genomics an Bioinformatics MS、PhD 生物学系
生物信息学 Bioinformatics MS、PhD 计算机与信息科学系
遗传学、基因组学与生物信息学 Genetics, Genomics, an Bioinformatics PhD 医学院
156 弗吉尼亚联邦大学 生物信息学 Bioinformatics Mbin、MS 文理学院
168 德州理工大学 生物信息学 Bioinformatics MS、PhD 计算机科学系
168 爱达荷大学 生物信息学与计算生物学 Bioinformatics & Computational Biology MS、PhD 工程学院
168 缅因大学 生物信息学 Bioinformatics MPS 自然科学与农林学院
180 新墨西哥大学 计算生物学与基因组学 Computational Biology & Genomics MS、PhD 生物学系
计算生物学 Computational Biology MS、PhD 计算机科学系